La CC Vanne et Pays d'Othe est composée de 22 communes. Seules 12 communes sont situées en tout ou partie dans le bassin versant de Yonne Médian.
- Arces-Dilo
- Cerisiers
- Courgenay
- La Postolle
- Lailly
- Les Clérimois
- Pont-sur-Vanne
- Saint-Maurice-aux-Riches-Hommes
- Vaudeurs
- Vaumort
- Villechêtive